More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1036 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  347  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  91.14 
 
 
168 aa  302  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  66.04 
 
 
171 aa  220  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  53.94 
 
 
171 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  55.03 
 
 
171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  53.85 
 
 
171 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  52.07 
 
 
171 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  52.35 
 
 
232 aa  174  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  48.24 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  53.12 
 
 
170 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  54.49 
 
 
166 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  54.49 
 
 
166 aa  168  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  53.85 
 
 
166 aa  168  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  50.6 
 
 
169 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  53.21 
 
 
166 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  55.1 
 
 
166 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  54.42 
 
 
166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  49.11 
 
 
171 aa  163  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  53.16 
 
 
172 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  52.7 
 
 
166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  53.38 
 
 
166 aa  160  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  49.04 
 
 
168 aa  159  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  51.57 
 
 
171 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  49.32 
 
 
167 aa  158  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  49.32 
 
 
167 aa  157  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  48.73 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  48.73 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  49.33 
 
 
164 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  44.44 
 
 
166 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  46.2 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  43.04 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  46.2 
 
 
164 aa  143  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  47.44 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  43.71 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.79 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.16 
 
 
197 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  42.86 
 
 
204 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  47.62 
 
 
165 aa  136  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.52 
 
 
197 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.52 
 
 
197 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  42.44 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  43.23 
 
 
197 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  43.23 
 
 
197 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  48 
 
 
197 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  48 
 
 
197 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  47.17 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.58 
 
 
197 aa  131  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  42.41 
 
 
197 aa  130  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  45.22 
 
 
181 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.18 
 
 
191 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  48.63 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  41.57 
 
 
179 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  47.62 
 
 
179 aa  124  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.33 
 
 
166 aa  124  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  42.24 
 
 
179 aa  123  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  47.3 
 
 
166 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  47.3 
 
 
166 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  42.41 
 
 
165 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  48.73 
 
 
165 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  44.59 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.37 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  48.06 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  42.68 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1130  Redoxin domain protein  41.18 
 
 
169 aa  118  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000023732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  46.62 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  44.59 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  45.95 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.67 
 
 
165 aa  117  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  39.64 
 
 
167 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  45.95 
 
 
166 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.23 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  44.59 
 
 
197 aa  117  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  44.17 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.27 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.75 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  44.17 
 
 
167 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  40.76 
 
 
167 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  40.12 
 
 
169 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  44.17 
 
 
167 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  43.92 
 
 
167 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  45.27 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  42.94 
 
 
168 aa  114  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  43.92 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.15 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  42.94 
 
 
168 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  42.94 
 
 
168 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  42.94 
 
 
168 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  42.94 
 
 
168 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  42.94 
 
 
168 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  43.24 
 
 
167 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  41.51 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  42.95 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.33 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  41.51 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  41.72 
 
 
168 aa  111  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>