More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1133 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  54.75 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  57.06 
 
 		 165 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  55.56 
 
 		 166 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  59.01 
 
 		 165 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  50.83 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  55.83 
 
 		 164 aa  194  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  57.41 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  53.99 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  56.79 
 
 		 166 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  53.99 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  56.17 
 
 		 165 aa  191  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  56.8 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  54.32 
 
 		 166 aa  188  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  53.09 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.6 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  57.67 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  57.67 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  55.83 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  53.42 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  54.66 
 
 		 165 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  54.6 
 
 		 166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  53.09 
 
 		 173 aa  181  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  58.64 
 
 		 165 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  51.53 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  51.53 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  52.2 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  51.85 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  52.47 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  50.31 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  50.31 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.76 
 
 		 166 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 168 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  51.85 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 167 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  49.69 
 
 		 168 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  51.53 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15610  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  54.84 
 
 		 161 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  52.47 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  51.53 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  50.3 
 
 		 167 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  48.47 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  48.47 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  53.37 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  48.47 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  48.47 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  48.47 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  52.76 
 
 		 166 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.69 
 
 		 166 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  50.92 
 
 		 167 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  51.53 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  49.08 
 
 		 168 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  50.92 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  51.23 
 
 		 165 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  50.92 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  50.92 
 
 		 166 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 		 166 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  48.78 
 
 		 167 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  51.53 
 
 		 166 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  50.92 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  50.92 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  50.96 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  48.17 
 
 		 167 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  48.17 
 
 		 167 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  48.17 
 
 		 167 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  48.17 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.17 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.85 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  48.17 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.85 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  48.17 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  49.39 
 
 		 165 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.47 
 
 		 166 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  48.47 
 
 		 166 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 		 163 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  48.47 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  46.95 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  46.45 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2432  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.92 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.399489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.53 
 
 		 228 aa  140  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  45.12 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  45.51 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  44.9 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  41.36 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  44.17 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  42.94 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  41.36 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  44.79 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>