More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5269 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  52.66 
 
 
171 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  55.15 
 
 
171 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  51.48 
 
 
171 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.3 
 
 
171 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  55.7 
 
 
172 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  52.07 
 
 
169 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  46.75 
 
 
171 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  50.89 
 
 
171 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  54.09 
 
 
170 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  51.85 
 
 
166 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  51.63 
 
 
167 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  54.9 
 
 
166 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  51.23 
 
 
166 aa  174  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  51.23 
 
 
166 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  51.63 
 
 
167 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  54.72 
 
 
171 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  51.23 
 
 
166 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  52.94 
 
 
166 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  52.94 
 
 
166 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  52.94 
 
 
166 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  52.94 
 
 
166 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  52.94 
 
 
166 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  52.94 
 
 
166 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  53.12 
 
 
168 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.63 
 
 
228 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  53.59 
 
 
166 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  53.33 
 
 
165 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  46.34 
 
 
166 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  53.25 
 
 
167 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  49.4 
 
 
173 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  44.12 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  52.94 
 
 
166 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  42.94 
 
 
168 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  47.88 
 
 
181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  43.35 
 
 
204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  52.15 
 
 
172 aa  160  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.73 
 
 
191 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.05 
 
 
197 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.05 
 
 
197 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 
165 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  51.35 
 
 
168 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  42.35 
 
 
197 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  42.35 
 
 
197 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  44.51 
 
 
199 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.33 
 
 
197 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  46.3 
 
 
164 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  47.24 
 
 
164 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  47.24 
 
 
164 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  41.04 
 
 
197 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  41.72 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  48.12 
 
 
165 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  41.72 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  44.17 
 
 
164 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.72 
 
 
197 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  52.12 
 
 
165 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.08 
 
 
165 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  43.56 
 
 
164 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  44.17 
 
 
164 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.63 
 
 
166 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  50.3 
 
 
167 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  47.88 
 
 
165 aa  151  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  47.85 
 
 
166 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  48.78 
 
 
166 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  46.95 
 
 
170 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  43.53 
 
 
167 aa  148  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.17 
 
 
166 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  46.01 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  48.48 
 
 
167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  46.95 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.7 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.95 
 
 
187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.01 
 
 
168 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  47.56 
 
 
166 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 
167 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  49.7 
 
 
167 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 
167 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  46.95 
 
 
166 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  49.7 
 
 
167 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.98 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  46.95 
 
 
167 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  46.95 
 
 
167 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  43.12 
 
 
179 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  46.95 
 
 
166 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  49.09 
 
 
167 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.88 
 
 
175 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  47.5 
 
 
167 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  46.63 
 
 
165 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.63 
 
 
166 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  45.18 
 
 
168 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  46.11 
 
 
167 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  46.67 
 
 
167 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  47.56 
 
 
166 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  47.4 
 
 
165 aa  141  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>