More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2752 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  100 
 
 
166 aa  335  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  87.95 
 
 
166 aa  297  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  83.73 
 
 
166 aa  284  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  82.53 
 
 
166 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  82.53 
 
 
166 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  81.93 
 
 
166 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  82.53 
 
 
166 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  75.76 
 
 
165 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  75.15 
 
 
165 aa  248  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2432  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  75.9 
 
 
166 aa  237  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.399489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  68.86 
 
 
167 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  68.86 
 
 
167 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  68.26 
 
 
168 aa  231  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  67.66 
 
 
168 aa  230  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  67.66 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  67.66 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  67.66 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  67.66 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  67.66 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  67.66 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  67.66 
 
 
168 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  71.08 
 
 
166 aa  229  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  69.51 
 
 
167 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  68.67 
 
 
166 aa  228  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  67.07 
 
 
168 aa  228  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.67 
 
 
166 aa  228  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  67.07 
 
 
167 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  67.07 
 
 
167 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  69.51 
 
 
167 aa  224  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  67.47 
 
 
166 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  64.46 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  66.27 
 
 
166 aa  223  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  64.46 
 
 
166 aa  221  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  63.86 
 
 
166 aa  221  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  64.07 
 
 
168 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  64.07 
 
 
168 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  64.07 
 
 
168 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  64.07 
 
 
168 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  64.07 
 
 
168 aa  220  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  66.26 
 
 
167 aa  219  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  64.67 
 
 
167 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  65.06 
 
 
166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  63.47 
 
 
167 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  63.47 
 
 
167 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  63.47 
 
 
167 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.8 
 
 
165 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  63.47 
 
 
167 aa  213  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  63.47 
 
 
167 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  62.28 
 
 
167 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  62.28 
 
 
167 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  60 
 
 
165 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  62.05 
 
 
187 aa  208  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  61.68 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  61.68 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  61.68 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  62.05 
 
 
167 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  61.68 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  62.05 
 
 
167 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  61.68 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  61.68 
 
 
167 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  59.04 
 
 
166 aa  207  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  63.25 
 
 
166 aa  206  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  64.24 
 
 
165 aa  206  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  61.08 
 
 
167 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  61.82 
 
 
164 aa  204  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  61.45 
 
 
166 aa  204  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  58.18 
 
 
166 aa  204  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  58.18 
 
 
166 aa  203  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  62.03 
 
 
166 aa  203  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  61.21 
 
 
165 aa  203  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  59.26 
 
 
166 aa  202  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  61.96 
 
 
163 aa  201  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  59.39 
 
 
166 aa  201  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  58.64 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  57.49 
 
 
179 aa  195  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  59.04 
 
 
187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  60.61 
 
 
165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  57.58 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  56.97 
 
 
168 aa  191  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  56.97 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  55.76 
 
 
166 aa  187  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  56.97 
 
 
168 aa  184  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  58.18 
 
 
165 aa  184  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  54.6 
 
 
197 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  52.12 
 
 
175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  54.82 
 
 
165 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  51.81 
 
 
199 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  51.81 
 
 
165 aa  177  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2756  redoxin domain protein  52.73 
 
 
166 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  54.09 
 
 
165 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.12 
 
 
166 aa  174  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  54.22 
 
 
165 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1604  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.12 
 
 
169 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510927  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0349  thiol peroxidase  46.91 
 
 
164 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15610  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.17 
 
 
161 aa  157  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  45.18 
 
 
170 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  46.39 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  46.39 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  45.06 
 
 
175 aa  144  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  47.47 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>