260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2534 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  100 
 
 
167 aa  342  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  53.09 
 
 
170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  52.07 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  50.92 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  53.25 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  50.92 
 
 
166 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  50.31 
 
 
166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 
166 aa  160  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  52.44 
 
 
168 aa  160  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  51.3 
 
 
166 aa  157  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  46.78 
 
 
171 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  50 
 
 
166 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.65 
 
 
171 aa  154  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  49.69 
 
 
179 aa  153  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  49.35 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  48.5 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  49.35 
 
 
166 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  49.35 
 
 
166 aa  150  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  49.35 
 
 
166 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  49.35 
 
 
166 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  49.35 
 
 
166 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  47.06 
 
 
173 aa  150  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  47.5 
 
 
166 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  47.5 
 
 
172 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  43.53 
 
 
232 aa  148  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  48.47 
 
 
164 aa  148  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  48.77 
 
 
166 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  48.47 
 
 
164 aa  148  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  47.5 
 
 
166 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  48.47 
 
 
167 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  48.47 
 
 
167 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  48.47 
 
 
181 aa  147  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  48.15 
 
 
167 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  44.71 
 
 
171 aa  147  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.47 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0783  thiol peroxidase  50.32 
 
 
174 aa  144  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0870  thiol peroxidase  50.33 
 
 
175 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0445504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0800  thiol peroxidase  50.33 
 
 
175 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.341037  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  42.33 
 
 
164 aa  142  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.68 
 
 
166 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1232  thiol peroxidase  50.33 
 
 
175 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  46.91 
 
 
166 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  46.63 
 
 
165 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  44.72 
 
 
175 aa  142  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.3 
 
 
166 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  42.94 
 
 
171 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  45.73 
 
 
164 aa  140  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  47.5 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  45.4 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  47.24 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  45.28 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  46.3 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  46.3 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.06 
 
 
166 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  47.17 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.3 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  45.68 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.56 
 
 
163 aa  137  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  45.06 
 
 
187 aa  137  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.56 
 
 
165 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  44.65 
 
 
165 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  45.96 
 
 
172 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  46.25 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  46.01 
 
 
179 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  42.94 
 
 
164 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  46.63 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  46.63 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  46.63 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  46.63 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  46.63 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  46.63 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  46.25 
 
 
165 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  45.62 
 
 
166 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  43.12 
 
 
173 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  46.01 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  46.34 
 
 
169 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.51 
 
 
191 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  45.91 
 
 
165 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  46.63 
 
 
167 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  45.06 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  45.57 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  41.72 
 
 
164 aa  134  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  45.68 
 
 
166 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.2 
 
 
197 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  46.3 
 
 
166 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.12 
 
 
166 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  45.4 
 
 
169 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.515371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  45.06 
 
 
197 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  44.23 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  43.21 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  42.41 
 
 
166 aa  134  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  43.12 
 
 
166 aa  134  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  45.34 
 
 
167 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  45.34 
 
 
167 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  46.01 
 
 
167 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  46.01 
 
 
167 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.95 
 
 
228 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  43.23 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  43.83 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.01 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>