More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2802 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.39 
 
 		 197 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.39 
 
 		 197 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  67.88 
 
 		 197 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  66.15 
 
 		 197 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  66.15 
 
 		 197 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  65.64 
 
 		 197 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  65.64 
 
 		 197 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  64.25 
 
 		 197 aa  259  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  64.74 
 
 		 197 aa  257  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  65.57 
 
 		 204 aa  254  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  67.04 
 
 		 191 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  58.9 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  44.12 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.47 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  49.67 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  50 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  49.67 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  46.91 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  47.27 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  46.63 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  50.33 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  46.06 
 
 		 164 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  46.06 
 
 		 164 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  49.38 
 
 		 171 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  48.39 
 
 		 170 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  46.11 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  46.25 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  44.85 
 
 		 164 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  50.33 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  42.62 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  41.1 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  45.91 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.03 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  45.91 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  41.21 
 
 		 168 aa  145  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  44.85 
 
 		 166 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  45.91 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  45.91 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  44.94 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  42.33 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.46 
 
 		 165 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  43.87 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  44.24 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  43.56 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  42.33 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  45.1 
 
 		 166 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  45.1 
 
 		 166 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 173 aa  138  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  45.1 
 
 		 166 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  45.1 
 
 		 166 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  45.1 
 
 		 166 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  42.94 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  45.1 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  42.33 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  43.29 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.94 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  39.39 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  40.36 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  40.24 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.36 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.33 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  42.77 
 
 		 167 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  41.82 
 
 		 166 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  41.21 
 
 		 166 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  45.06 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  39.39 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  40.49 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  41.21 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  40.74 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  40.74 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  41.25 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.79 
 
 		 166 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  42.14 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  40.61 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  41.1 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  41.72 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  38.12 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  40.74 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.17 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  42.14 
 
 		 167 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  41.21 
 
 		 166 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.46 
 
 		 165 aa  131  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  40.85 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  40.61 
 
 		 175 aa  131  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  44.24 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  43.29 
 
 		 165 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  42.77 
 
 		 167 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  42.77 
 
 		 167 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  37.58 
 
 		 166 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  40 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  44.24 
 
 		 179 aa  130  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1952  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.72 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.386734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.72 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  41.1 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  41.1 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.41 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>