More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2901 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
169 aa  345  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  74.27 
 
 
171 aa  261  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  72.51 
 
 
171 aa  256  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  73.2 
 
 
167 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  73.2 
 
 
167 aa  240  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  66.08 
 
 
171 aa  239  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  66.47 
 
 
171 aa  229  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  64.67 
 
 
171 aa  223  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.12 
 
 
171 aa  220  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  64.05 
 
 
166 aa  207  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  58.9 
 
 
166 aa  207  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  65.41 
 
 
172 aa  207  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  64.71 
 
 
170 aa  207  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  58.9 
 
 
166 aa  206  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  58.9 
 
 
166 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  63.4 
 
 
166 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  58.28 
 
 
166 aa  203  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  58.44 
 
 
166 aa  197  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  58.44 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  58.44 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  58.44 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  58.44 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  58.44 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  58.44 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  60.39 
 
 
165 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  56.44 
 
 
164 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  56.44 
 
 
164 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  57.14 
 
 
167 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 
168 aa  184  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  52.07 
 
 
232 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  50.92 
 
 
164 aa  179  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  54.76 
 
 
173 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  50.29 
 
 
171 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  52.32 
 
 
168 aa  161  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  50.32 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  44.44 
 
 
164 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  47.62 
 
 
197 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  47.62 
 
 
197 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  47.62 
 
 
197 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  45.4 
 
 
164 aa  159  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  47.62 
 
 
197 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.43 
 
 
197 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.43 
 
 
197 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  50.91 
 
 
166 aa  157  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.33 
 
 
228 aa  157  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  50.6 
 
 
181 aa  157  6e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  47.24 
 
 
164 aa  157  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.83 
 
 
197 aa  157  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 
165 aa  157  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  50.99 
 
 
171 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  43.64 
 
 
166 aa  155  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  45.83 
 
 
197 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  52.12 
 
 
166 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  51.92 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  44.58 
 
 
204 aa  154  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  52.12 
 
 
166 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  46.63 
 
 
197 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.63 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 
163 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  47.27 
 
 
170 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.24 
 
 
197 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.3 
 
 
166 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  48.48 
 
 
167 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  50.61 
 
 
167 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 
187 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  49.09 
 
 
168 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  50.61 
 
 
167 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  46.91 
 
 
168 aa  147  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  48.8 
 
 
167 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  48.8 
 
 
167 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  47.9 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  48.48 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  47.31 
 
 
168 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  47.31 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  47.31 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  47.31 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  48.48 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  47.31 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  47.31 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  50 
 
 
166 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.17 
 
 
166 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  47.59 
 
 
167 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  48.75 
 
 
165 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  48.48 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.01 
 
 
166 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  48.48 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  44.79 
 
 
172 aa  142  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  45.73 
 
 
166 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.56 
 
 
166 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  47.56 
 
 
166 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  48.15 
 
 
165 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  46.91 
 
 
166 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>