More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0352 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  80.12 
 
 		 171 aa  287  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  77.19 
 
 		 171 aa  280  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  74.51 
 
 		 167 aa  247  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  73.86 
 
 		 167 aa  244  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  66.08 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  60.48 
 
 		 171 aa  215  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  65.82 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65 
 
 		 171 aa  213  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  59.06 
 
 		 171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  63.4 
 
 		 166 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  61.39 
 
 		 170 aa  204  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  60.78 
 
 		 166 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  57.41 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  57.41 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  57.41 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  56.79 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  59.48 
 
 		 166 aa  193  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  59.48 
 
 		 166 aa  193  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  59.48 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  59.48 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  59.48 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  59.48 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  59.48 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  51.48 
 
 		 232 aa  188  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  56.21 
 
 		 165 aa  183  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  46.78 
 
 		 171 aa  181  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  48.47 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  53.57 
 
 		 173 aa  177  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  54.25 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  50.31 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  52.87 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  52.87 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  53.8 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  45.73 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  51.9 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  48.73 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.35 
 
 		 228 aa  160  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  45.12 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  44.79 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  50.92 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  44.79 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  45.12 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  44.51 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.51 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.51 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.51 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.06 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  42.94 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  46.63 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  47.59 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  44.23 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  44.23 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.68 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  44.23 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  44.23 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  44.23 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.59 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  46.25 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  47.44 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  45.06 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  42.94 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.34 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.01 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  43.56 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  46.34 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  46.34 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.77 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  45.12 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  48.65 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  43.71 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  43.71 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.62 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  40.72 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  45.12 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  42.77 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  44.58 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.515371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  44.79 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  44.51 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  45.12 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  43.64 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  41.46 
 
 		 199 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  42.59 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  43.11 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  42.42 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  42.42 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  43.75 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  44.38 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  44.38 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  43.12 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  41.82 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  43.12 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  41.82 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>