213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0554 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  49.35 
 
 
166 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  46.75 
 
 
166 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.8 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  40.23 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  40.72 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 
166 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  42.86 
 
 
166 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  42.24 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  42.24 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  40.57 
 
 
171 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  43.71 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  40.85 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  40.7 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  41.83 
 
 
169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  40.4 
 
 
167 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  42.38 
 
 
166 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  41.51 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  42.38 
 
 
166 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  42.38 
 
 
166 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  40.4 
 
 
167 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  42.38 
 
 
166 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  42.38 
 
 
166 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  42.38 
 
 
166 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  43.2 
 
 
171 aa  122  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  42.33 
 
 
172 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  43.05 
 
 
165 aa  121  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  41.51 
 
 
171 aa  121  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  41.51 
 
 
168 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  43.42 
 
 
170 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.13 
 
 
228 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  39.88 
 
 
173 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  40.88 
 
 
167 aa  114  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.36 
 
 
171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  41.36 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  35.54 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  41.36 
 
 
166 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.74 
 
 
166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  40.13 
 
 
167 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  36.77 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  39.1 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  39.1 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  39.51 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1130  Redoxin domain protein  33.75 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000023732  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  33.76 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  37.34 
 
 
181 aa  107  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  40.12 
 
 
166 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  39.51 
 
 
166 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  39.51 
 
 
166 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  35.26 
 
 
164 aa  104  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  35.4 
 
 
197 aa  104  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  35.22 
 
 
164 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.04 
 
 
165 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.27 
 
 
166 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.51 
 
 
163 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  39.87 
 
 
167 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  39.87 
 
 
167 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.29 
 
 
166 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  35.06 
 
 
164 aa  101  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  35.4 
 
 
170 aa  101  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40 
 
 
166 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  37.27 
 
 
166 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  35.22 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.62 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.62 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  39.35 
 
 
166 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.62 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  33.13 
 
 
191 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  35.62 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
197 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  37.27 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.62 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  38.96 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  40.13 
 
 
167 aa  99  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  34.73 
 
 
172 aa  98.2  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  40 
 
 
166 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  36.88 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  38.27 
 
 
167 aa  97.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  38.27 
 
 
167 aa  97.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.56 
 
 
187 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  38.71 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  37.25 
 
 
165 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  37.66 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  39.46 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  36.42 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  39.13 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  34.36 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  38.71 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  34.81 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  41.18 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  36.31 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  36.02 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  39.46 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  39.46 
 
 
167 aa  94.4  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  38.06 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  37.27 
 
 
165 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  40.82 
 
 
167 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>