More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0473 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  100 
 
 
164 aa  333  5e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  58.9 
 
 
171 aa  210  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  53.59 
 
 
166 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  49.69 
 
 
166 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  48.75 
 
 
171 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  49.69 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  49.69 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  49.07 
 
 
166 aa  175  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  52.63 
 
 
166 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  50 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  50 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  50 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  50 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  50 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  50 
 
 
166 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
166 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  48.05 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  47.24 
 
 
164 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  47.24 
 
 
164 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  47.24 
 
 
164 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  48.05 
 
 
167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  47.27 
 
 
166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  47.71 
 
 
172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.35 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  47.4 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  46.91 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  44.79 
 
 
171 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  45.4 
 
 
169 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  43.9 
 
 
171 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.12 
 
 
197 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.12 
 
 
197 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  44.79 
 
 
171 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  45.45 
 
 
167 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.51 
 
 
197 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  42.14 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  44.51 
 
 
197 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  44.51 
 
 
197 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  43.56 
 
 
232 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  43.9 
 
 
197 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.51 
 
 
197 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  43.9 
 
 
197 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.94 
 
 
171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  44.72 
 
 
173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  42.68 
 
 
197 aa  150  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.46 
 
 
191 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.51 
 
 
228 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  46.63 
 
 
166 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  47.37 
 
 
179 aa  147  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  45.81 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  41.1 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.44 
 
 
168 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  44.44 
 
 
166 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  45.16 
 
 
165 aa  144  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  41.61 
 
 
166 aa  143  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  43.03 
 
 
199 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  44.44 
 
 
172 aa  143  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  42.33 
 
 
167 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  42.94 
 
 
165 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  42.94 
 
 
167 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  42.94 
 
 
167 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  42.94 
 
 
170 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  42.94 
 
 
167 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  45.12 
 
 
168 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  43.29 
 
 
168 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  43.21 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  43.29 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  43.29 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  43.29 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  43.29 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  43.29 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  42.94 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  38.04 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  43.29 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  43.29 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  43.56 
 
 
167 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  42.57 
 
 
171 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  43.62 
 
 
168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  42.68 
 
 
168 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.46 
 
 
165 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 
163 aa  137  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  42.59 
 
 
164 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  41.98 
 
 
166 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  43.83 
 
 
165 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  41.72 
 
 
165 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  41.61 
 
 
167 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.98 
 
 
166 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.46 
 
 
166 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  44.17 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  41.25 
 
 
179 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  44.17 
 
 
167 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  42.42 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  42.42 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  42.42 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  42.42 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  42.42 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  42.42 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  41.57 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  43.83 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  41.82 
 
 
167 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>