More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3341 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  91.88 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  89.85 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  89.85 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  85.79 
 
 		 197 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  85.79 
 
 		 197 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  85.79 
 
 		 197 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  85.79 
 
 		 197 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  78.17 
 
 		 197 aa  327  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  64.25 
 
 		 197 aa  259  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  65.45 
 
 		 191 aa  258  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  67.24 
 
 		 204 aa  249  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  62.11 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  48.47 
 
 		 171 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  47.5 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  51.61 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  47.77 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  52.74 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  47.77 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  47.77 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.79 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  41.72 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  44.51 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  47.77 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  46.25 
 
 		 166 aa  151  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  44.75 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  47.44 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  45.24 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  46.15 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  46.15 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  44.23 
 
 		 171 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  46.11 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  43.59 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  44.9 
 
 		 170 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  43.23 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  43.15 
 
 		 172 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  47.26 
 
 		 166 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  47.26 
 
 		 166 aa  141  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  47.26 
 
 		 166 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  47.26 
 
 		 166 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  47.26 
 
 		 166 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  47.26 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  43.23 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.18 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  41.21 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  42.76 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  46.58 
 
 		 166 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  42.33 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  40.85 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  40.99 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  40.96 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  40.99 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  41.57 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  42.86 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.48 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  43.11 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  39.77 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  46.2 
 
 		 167 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.36 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  41.57 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  41.07 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  41.67 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  46.88 
 
 		 168 aa  134  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  40.36 
 
 		 167 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  40.36 
 
 		 167 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  42.17 
 
 		 165 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  42.17 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.57 
 
 		 166 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  40.36 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  43.31 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  41.57 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  43.31 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  41.21 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  40.36 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  41.57 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  44.83 
 
 		 175 aa  132  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  36.97 
 
 		 168 aa  131  6.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  42.26 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  41.82 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  43.56 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  45.18 
 
 		 173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  42.86 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  40.12 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.96 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  40.96 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  41.21 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.79 
 
 		 165 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  41.21 
 
 		 165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  40.72 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  41.57 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  39.16 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  39.16 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  42.68 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  40.36 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.96 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  42.04 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1952  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.36 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.386734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>