More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2959 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  100 
 
 
171 aa  348  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  78.95 
 
 
171 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  77.19 
 
 
171 aa  280  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  72.51 
 
 
169 aa  256  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  72.26 
 
 
167 aa  243  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  72.26 
 
 
167 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  64.67 
 
 
171 aa  234  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  64.91 
 
 
171 aa  228  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  64.38 
 
 
171 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  63.29 
 
 
172 aa  206  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  57.32 
 
 
166 aa  206  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  57.32 
 
 
166 aa  205  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  57.32 
 
 
166 aa  204  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  63.4 
 
 
166 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  56.71 
 
 
166 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  61.29 
 
 
166 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  58.06 
 
 
166 aa  198  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  58.06 
 
 
166 aa  198  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  58.06 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  58.06 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  58.06 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  58.06 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  58.06 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  60.13 
 
 
170 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  52.66 
 
 
232 aa  194  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  51.83 
 
 
168 aa  188  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  57.79 
 
 
167 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  48.54 
 
 
171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  54.76 
 
 
173 aa  181  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  53.25 
 
 
165 aa  180  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  53.99 
 
 
164 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  53.99 
 
 
164 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  49.08 
 
 
164 aa  174  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  53.8 
 
 
168 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  53.8 
 
 
168 aa  168  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  48.77 
 
 
164 aa  167  9e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.35 
 
 
228 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  50 
 
 
171 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  46.67 
 
 
166 aa  159  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  49.7 
 
 
170 aa  158  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  43.9 
 
 
164 aa  157  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  47.85 
 
 
164 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  48.17 
 
 
168 aa  154  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.08 
 
 
197 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  48.72 
 
 
197 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  43.79 
 
 
204 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  48.48 
 
 
181 aa  153  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.97 
 
 
197 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.97 
 
 
197 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  48.08 
 
 
197 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  48.72 
 
 
197 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  48.08 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  49.38 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  48.08 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  50.3 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.2 
 
 
191 aa  150  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.44 
 
 
197 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  44.71 
 
 
167 aa  147  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  48.48 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.27 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.67 
 
 
165 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.48 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.27 
 
 
163 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  48.8 
 
 
187 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  47.62 
 
 
168 aa  142  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  44.91 
 
 
199 aa  141  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  48.17 
 
 
166 aa  141  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  47.27 
 
 
167 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.31 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  47.56 
 
 
165 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  45.45 
 
 
166 aa  137  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  47.88 
 
 
166 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  43.29 
 
 
172 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  46.3 
 
 
166 aa  137  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.29 
 
 
168 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  47.27 
 
 
166 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  47.88 
 
 
166 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  45.51 
 
 
169 aa  136  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  45.45 
 
 
167 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  45.86 
 
 
166 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  45.45 
 
 
167 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  45.12 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.73 
 
 
166 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  45.18 
 
 
167 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  45.18 
 
 
167 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  45.73 
 
 
165 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.78 
 
 
166 aa  134  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  49.32 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  45.96 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  44.31 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.58 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  45.45 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  40.23 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  44.91 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  44.91 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  44.91 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  44.91 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  44.91 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  44.85 
 
 
197 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>