More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0867 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  77.85 
 
 		 172 aa  265  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  74.21 
 
 		 171 aa  258  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  62.72 
 
 		 171 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  58.33 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  66.01 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  64.94 
 
 		 167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  63.41 
 
 		 169 aa  214  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  61.96 
 
 		 166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  61.96 
 
 		 166 aa  214  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  60.95 
 
 		 171 aa  213  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  61.96 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  59.39 
 
 		 171 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  61.35 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  62.75 
 
 		 166 aa  210  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  62.75 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  62.09 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  62.09 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  62.09 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  62.09 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  62.09 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  62.09 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  59.17 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  60.13 
 
 		 167 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  60.13 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  58.39 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  58.39 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  53.42 
 
 		 164 aa  187  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  54.44 
 
 		 232 aa  187  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  52.41 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  47.65 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  52.17 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  47.53 
 
 		 164 aa  177  8e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  54.05 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.65 
 
 		 228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  53.12 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  52.5 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  45.34 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  51.95 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  47.53 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  46.99 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  49.69 
 
 		 197 aa  160  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.15 
 
 		 191 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  48.05 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  48.05 
 
 		 197 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  48.05 
 
 		 197 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  47.4 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  47.4 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.1 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.1 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  46.91 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.4 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  46.95 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  45.61 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  45.51 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.67 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  46.34 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  45.73 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  49.66 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  44.79 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  45.12 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.37 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.85 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  45.51 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  45.51 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  44.58 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  45.73 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  46.95 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  42.68 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  44.51 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  43.64 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  43.64 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  44.51 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.71 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  46.63 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  44.91 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  45.4 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  43.03 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  45.12 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  45.45 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  44.51 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  43.03 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  43.03 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  43.03 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.79 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  43.03 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  46.63 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  43.03 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  43.37 
 
 		 199 aa  134  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  45.96 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  43.9 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.68 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  43.56 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>