247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0630 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  100 
 
 
169 aa  340  4e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  55.36 
 
 
179 aa  192  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  56.29 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  52.69 
 
 
167 aa  184  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  50 
 
 
170 aa  184  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  53.01 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  50.6 
 
 
175 aa  180  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  52.12 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0323  thiol peroxidase (scavengase P20)  48.8 
 
 
174 aa  162  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000438204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0783  thiol peroxidase  51.88 
 
 
174 aa  155  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  45.56 
 
 
166 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  44.97 
 
 
166 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  44.97 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  44.97 
 
 
166 aa  151  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  46.84 
 
 
166 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  47.47 
 
 
166 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1232  thiol peroxidase  47.77 
 
 
175 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0870  thiol peroxidase  47.77 
 
 
175 aa  147  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0445504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0800  thiol peroxidase  47.77 
 
 
175 aa  147  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.341037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  44.24 
 
 
171 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  44.44 
 
 
171 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  45.06 
 
 
171 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  43.04 
 
 
166 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  43.04 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  43.04 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  43.04 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  43.04 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  43.04 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  43.37 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  43.04 
 
 
166 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  42.5 
 
 
167 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  45.51 
 
 
171 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.77 
 
 
166 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.44 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  41.88 
 
 
167 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  45.16 
 
 
170 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  42.77 
 
 
166 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.17 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  42.17 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  44.81 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  42.17 
 
 
167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  44.74 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  40.96 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.515371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  43.9 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  40.85 
 
 
167 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.52 
 
 
171 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  39.76 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  42.51 
 
 
169 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  41.92 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  42.51 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  42.51 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  40.96 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  40.96 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  42.51 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  42.51 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  42.51 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  42.51 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  42.51 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  44.72 
 
 
232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.99 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  40.36 
 
 
166 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  43.21 
 
 
166 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  42.77 
 
 
164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  42.77 
 
 
164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  40.72 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  40.72 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  41.32 
 
 
167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  37.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  37.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  39.63 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.17 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  37.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  37.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  37.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  37.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  37.58 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  36.97 
 
 
168 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  38.79 
 
 
166 aa  124  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  36.97 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.49 
 
 
228 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  40.72 
 
 
167 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  40.72 
 
 
167 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  38.27 
 
 
171 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  41.82 
 
 
166 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  38.18 
 
 
167 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  38.18 
 
 
167 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.76 
 
 
166 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  36.48 
 
 
164 aa  123  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  40.12 
 
 
167 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  42.17 
 
 
165 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  38.18 
 
 
175 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  38.18 
 
 
168 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  39.51 
 
 
173 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  40.61 
 
 
166 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.13 
 
 
197 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  36.97 
 
 
167 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  40.62 
 
 
167 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  37.2 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  38.36 
 
 
197 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>