More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0408 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  91.14 
 
 
168 aa  302  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  67.3 
 
 
171 aa  224  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  54.55 
 
 
171 aa  181  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  53.85 
 
 
171 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  54.44 
 
 
171 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  52.5 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  55.13 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  55.77 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  50.3 
 
 
171 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  54.49 
 
 
166 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  56.46 
 
 
166 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  54.49 
 
 
166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  52.47 
 
 
169 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  46.47 
 
 
171 aa  165  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  50.63 
 
 
232 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  54.42 
 
 
166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  53.38 
 
 
166 aa  163  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  54.05 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  47.93 
 
 
171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  53.38 
 
 
166 aa  160  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  51.27 
 
 
172 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.69 
 
 
171 aa  157  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  48.41 
 
 
168 aa  155  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  48.65 
 
 
167 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  48.65 
 
 
167 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  45.68 
 
 
166 aa  153  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  48.15 
 
 
164 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  50.31 
 
 
164 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  50.31 
 
 
164 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  49.07 
 
 
164 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.75 
 
 
228 aa  147  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  43.67 
 
 
164 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  47.17 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.81 
 
 
197 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.16 
 
 
197 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.16 
 
 
197 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  43.11 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  41.71 
 
 
197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  46.79 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  44.52 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  44.52 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  44.76 
 
 
204 aa  137  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  46.94 
 
 
165 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 
197 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 
197 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.23 
 
 
197 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  48.43 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.67 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.18 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  41.77 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  41.57 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  47.97 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  47.62 
 
 
179 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  51.27 
 
 
165 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  42.24 
 
 
179 aa  125  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  46.94 
 
 
166 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  46.26 
 
 
166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  45.18 
 
 
165 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  46.62 
 
 
166 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  43.95 
 
 
181 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.18 
 
 
168 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  45.16 
 
 
166 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1130  Redoxin domain protein  42.48 
 
 
169 aa  120  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000023732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  43.67 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  43.12 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  43.67 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.4 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  43.84 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  41.77 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1952  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.35 
 
 
165 aa  119  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.386734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  41.51 
 
 
168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  42.41 
 
 
167 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  39.64 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  41.51 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  40.51 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  41.51 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  45.95 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  41.51 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  41.51 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  41.51 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.27 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.84 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  40 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  42.86 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  41.36 
 
 
169 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.31 
 
 
165 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  40.25 
 
 
168 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  46.83 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>