More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1360 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  66.85 
 
 		 197 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.89 
 
 		 197 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.89 
 
 		 197 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  67.78 
 
 		 197 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  67.78 
 
 		 197 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  65.57 
 
 		 197 aa  254  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  67.78 
 
 		 197 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  67.78 
 
 		 197 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  67.24 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  65.36 
 
 		 197 aa  244  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  61.83 
 
 		 191 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  60.53 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.85 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  43.35 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  48.1 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 		 171 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 		 169 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  44.38 
 
 		 171 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  43.79 
 
 		 171 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.51 
 
 		 166 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 172 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  48.37 
 
 		 166 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  42.94 
 
 		 171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  47.71 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  46.41 
 
 		 167 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  46.41 
 
 		 167 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.5 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  40.24 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  43.21 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  43.21 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  42.59 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  45.1 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  42.59 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  38.04 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  38.04 
 
 		 171 aa  138  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  46.85 
 
 		 164 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  46.85 
 
 		 164 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  42.17 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  43.51 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  43.51 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  43.51 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  43.51 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  43.51 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  43.51 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  43.51 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  37.95 
 
 		 168 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  41.29 
 
 		 167 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  47.37 
 
 		 171 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  40.12 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  42.42 
 
 		 166 aa  131  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  42.66 
 
 		 164 aa  131  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  39.13 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  45.11 
 
 		 168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  43.06 
 
 		 168 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.63 
 
 		 165 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  41.82 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.21 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  39.63 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  39.52 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  38.18 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.02 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  38.55 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  41.46 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.26 
 
 		 165 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  38.41 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  38.12 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  40.12 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  39.49 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  37.95 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  38.55 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  40 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  38.32 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.61 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  39.35 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  37.2 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  40 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  34.13 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.39 
 
 		 168 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  39.02 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  39.39 
 
 		 166 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  37.95 
 
 		 166 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  33.51 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.63 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  38.41 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.41 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  39.16 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  38.79 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  38.04 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  39.02 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  38.41 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  37.8 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>