30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7374 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  100 
 
 		 76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  94.2 
 
 		 69 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  51.32 
 
 		 76 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  52.63 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  48.68 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  51.35 
 
 		 76 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  47.37 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  47.37 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  48.61 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  46.05 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  45.83 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  47.37 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  45.45 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  45.95 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  44.59 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  41.1 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  38.96 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  45.16 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  40.54 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  43.84 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  36.36 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.26 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  35.06 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.06 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  32.35 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  36.07 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.07 
 
 		 88 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.07 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>