125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1657 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  343  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  88.1 
 
 		 168 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  96.43 
 
 		 168 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  85.12 
 
 		 168 aa  299  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  82.74 
 
 		 168 aa  269  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  74.85 
 
 		 167 aa  264  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  74.85 
 
 		 167 aa  243  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  74.85 
 
 		 177 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  74.85 
 
 		 167 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  74.85 
 
 		 167 aa  241  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  69.46 
 
 		 167 aa  236  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  65.87 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  60.71 
 
 		 168 aa  216  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  64.46 
 
 		 168 aa  215  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  60.12 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  55.95 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  55.36 
 
 		 169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  60.48 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  53.57 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  59.88 
 
 		 166 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  59.88 
 
 		 166 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  56.33 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  51.88 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  51.25 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  52.83 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  51.85 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  52.26 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  51.9 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  52.53 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  51.9 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  50.92 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  50.62 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  49.38 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  49.69 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  49.69 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  49.69 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  55.06 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  49.37 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  49.37 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  49.37 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  53.8 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  53.7 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  49.67 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  47.83 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  47.83 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  49.33 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  53.8 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  47.83 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  47.83 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  47.83 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  47.83 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  47.83 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  47.83 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  48.41 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  51.28 
 
 		 217 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  47.5 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  49.37 
 
 		 247 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  49.36 
 
 		 196 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  49.04 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  49.04 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  51.83 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  43.4 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  49.38 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  46.45 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  45.34 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  49.38 
 
 		 180 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  46.2 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  51.27 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  49.69 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  49.37 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  47.13 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  50.31 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  47.47 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  45.51 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  47.17 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  45.22 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  45.62 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  49.7 
 
 		 187 aa  133  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  41.57 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  47.44 
 
 		 217 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  45.57 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  46.75 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  46.58 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  47.8 
 
 		 180 aa  130  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  47.8 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  48.34 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  41.88 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  44.59 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  46.83 
 
 		 149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  42.11 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  39.87 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  40.51 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  39.38 
 
 		 421 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  40.13 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  42.04 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  37.18 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  34.42 
 
 		 197 aa  91.3  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1999  protein of unknown function DUF892  32.14 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>