More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1507 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  60.09 
 
 		 913 aa  1144    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1507  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 915 aa  1893    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.498476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0199  molybdopterin oxidoreductase  72.57 
 
 		 917 aa  1419    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  28.5 
 
 		 909 aa  255  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  26.2 
 
 		 858 aa  250  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 		 911 aa  200  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  25.91 
 
 		 917 aa  183  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  24.46 
 
 		 974 aa  154  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.11 
 
 		 974 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  24.01 
 
 		 974 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.64 
 
 		 836 aa  143  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.27 
 
 		 928 aa  144  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.14 
 
 		 973 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.14 
 
 		 973 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.14 
 
 		 973 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.14 
 
 		 973 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.14 
 
 		 973 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.14 
 
 		 978 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.14 
 
 		 978 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  23.82 
 
 		 978 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.41 
 
 		 969 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  23.72 
 
 		 978 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.54 
 
 		 981 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  27.57 
 
 		 784 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.66 
 
 		 953 aa  129  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  29.52 
 
 		 800 aa  128  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.76 
 
 		 935 aa  128  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  24.33 
 
 		 981 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  23.21 
 
 		 978 aa  127  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  29.49 
 
 		 812 aa  126  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  23.19 
 
 		 843 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  23.58 
 
 		 932 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  25.53 
 
 		 833 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.56 
 
 		 942 aa  120  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 817 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  23.31 
 
 		 968 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  22.91 
 
 		 958 aa  118  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  23.3 
 
 		 928 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  23.81 
 
 		 932 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  22.68 
 
 		 961 aa  114  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  30.47 
 
 		 821 aa  114  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 		 789 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  21.31 
 
 		 856 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  25.8 
 
 		 851 aa  112  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.25 
 
 		 781 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 		 856 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  25.7 
 
 		 1155 aa  111  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.3 
 
 		 979 aa  110  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  24.41 
 
 		 777 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  26.67 
 
 		 800 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  28.01 
 
 		 778 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.51 
 
 		 923 aa  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 		 818 aa  108  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 938 aa  107  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  22.47 
 
 		 930 aa  105  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  28.19 
 
 		 817 aa  105  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  23.04 
 
 		 826 aa  105  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  24.04 
 
 		 765 aa  105  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.61 
 
 		 826 aa  105  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  22.12 
 
 		 855 aa  104  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  23.16 
 
 		 927 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  23.9 
 
 		 898 aa  103  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  28.98 
 
 		 973 aa  102  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  22.93 
 
 		 971 aa  99.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13690  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.04 
 
 		 871 aa  98.2  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.88 
 
 		 824 aa  98.2  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 		 866 aa  96.3  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  22.37 
 
 		 854 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.7 
 
 		 839 aa  95.9  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  22.37 
 
 		 854 aa  95.9  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  23.69 
 
 		 837 aa  95.1  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  24.73 
 
 		 1148 aa  94.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  25.08 
 
 		 820 aa  94.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.95 
 
 		 864 aa  94  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  25.87 
 
 		 952 aa  92.8  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  26.98 
 
 		 732 aa  92.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  23.6 
 
 		 951 aa  91.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 		 876 aa  89.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  25.4 
 
 		 804 aa  89.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  30.93 
 
 		 750 aa  89  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4358  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  21.99 
 
 		 862 aa  88.6  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.23 
 
 		 803 aa  88.6  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.05 
 
 		 910 aa  88.6  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  30.96 
 
 		 731 aa  88.2  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  31.62 
 
 		 698 aa  87.8  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.48 
 
 		 801 aa  87  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  30.3 
 
 		 1139 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2228  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.6 
 
 		 847 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555129  hitchhiker  0.00541759 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.2 
 
 		 805 aa  87.4  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1344  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  22.96 
 
 		 808 aa  86.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  23.96 
 
 		 967 aa  86.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2716  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.89 
 
 		 808 aa  86.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.818341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  23.7 
 
 		 955 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 759 aa  86.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.2 
 
 		 805 aa  86.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  30.28 
 
 		 698 aa  85.5  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  29.74 
 
 		 799 aa  85.1  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  22.92 
 
 		 794 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  31.12 
 
 		 701 aa  84.7  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>