24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0951 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0951  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  789    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0843  hypothetical protein  87.1 
 
 		 282 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5209  hypothetical protein  81.95 
 
 		 277 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.341446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  51.85 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0116  hypothetical protein  45.9 
 
 		 274 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3563  hypothetical protein  45.45 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.137385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0145  hypothetical protein  44.98 
 
 		 272 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  40.93 
 
 		 282 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0190  hypothetical protein  43.68 
 
 		 288 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3358  hypothetical protein  43.01 
 
 		 269 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21008  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3273  hypothetical protein  42.96 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  40.43 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  38.27 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  38.71 
 
 		 283 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3933  hypothetical protein  36.55 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  0.230827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0597  hypothetical protein  39.01 
 
 		 280 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0576  hypothetical protein  39.01 
 
 		 280 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1342  hypothetical protein  36.96 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4084  hypothetical protein  37.82 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.628164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2638  hypothetical protein  38.43 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  26.71 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  24.2 
 
 		 244 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  25.82 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  26.99 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>