47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3941 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  100 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  77.95 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  75.59 
 
 		 127 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  71.65 
 
 		 127 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  62.2 
 
 		 127 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  56.35 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  38.46 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  37.61 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  44.23 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  45.19 
 
 		 184 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  37.5 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  39.05 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  37.14 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  37.14 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  35.04 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  37.5 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  35.58 
 
 		 210 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  38.39 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  35.9 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  35.29 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  35.71 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  35.71 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  31.62 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  32.77 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  34.23 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  31.09 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  31.36 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  33.33 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  32.48 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  33.33 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  32.48 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  33.93 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  32.41 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  29.25 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  33.05 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  31.73 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  26.17 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  28.57 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  29.9 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  25.69 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  26.05 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  24.55 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  24.37 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  26.36 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  26.05 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0064  hypothetical protein  29.59 
 
 		 179 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>