More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2337 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  57.28 
 
 		 759 aa  875    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.41 
 
 		 759 aa  878    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  46.85 
 
 		 752 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  45.44 
 
 		 766 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  65.92 
 
 		 770 aa  967    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  46.72 
 
 		 752 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  55.6 
 
 		 773 aa  837    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  58.23 
 
 		 781 aa  866    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  56.06 
 
 		 771 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  55.64 
 
 		 776 aa  802    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  56.48 
 
 		 764 aa  811    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  56.26 
 
 		 774 aa  800    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  56.63 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  67.36 
 
 		 774 aa  1023    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  56.06 
 
 		 769 aa  817    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  56.63 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  56.48 
 
 		 759 aa  864    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  57.39 
 
 		 765 aa  823    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  55.75 
 
 		 768 aa  800    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  55.6 
 
 		 769 aa  822    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  54.26 
 
 		 770 aa  789    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  859    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  56.06 
 
 		 769 aa  817    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  56.63 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  56.63 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  56.63 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  56.63 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  53.21 
 
 		 779 aa  828    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  57.52 
 
 		 759 aa  852    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  56.8 
 
 		 758 aa  872    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  56.19 
 
 		 777 aa  856    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  56.69 
 
 		 774 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0826  malic enzyme  56.18 
 
 		 759 aa  845    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  56.06 
 
 		 769 aa  817    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  80.92 
 
 		 760 aa  1220    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  56.46 
 
 		 773 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  56.06 
 
 		 769 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  63.58 
 
 		 777 aa  946    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  57.14 
 
 		 759 aa  874    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  56.06 
 
 		 769 aa  817    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  56.34 
 
 		 765 aa  849    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  58.2 
 
 		 759 aa  853    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  56.48 
 
 		 756 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  56.63 
 
 		 785 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  57.01 
 
 		 782 aa  834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  46.99 
 
 		 752 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  46.39 
 
 		 749 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  54.56 
 
 		 757 aa  812    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  56.66 
 
 		 766 aa  808    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3143  malic enzyme  68.59 
 
 		 760 aa  1016    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231587  normal  0.133413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2100  malic enzyme  68.5 
 
 		 774 aa  1016    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  56.19 
 
 		 768 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  56.5 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2754  malic enzyme  56.63 
 
 		 780 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223736  normal  0.851039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  88.41 
 
 		 769 aa  1297    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  55.91 
 
 		 759 aa  841    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  83.75 
 
 		 769 aa  1328    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0827  malic enzyme  67.96 
 
 		 777 aa  999    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  55.97 
 
 		 759 aa  857    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  56.36 
 
 		 758 aa  809    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  55.07 
 
 		 769 aa  838    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  56.33 
 
 		 771 aa  833    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  100 
 
 		 769 aa  1553    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  56.95 
 
 		 767 aa  836    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  55.91 
 
 		 772 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  56.14 
 
 		 760 aa  875    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  54.86 
 
 		 779 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  54.58 
 
 		 772 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  58.96 
 
 		 764 aa  922    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  87.37 
 
 		 769 aa  1297    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  57.93 
 
 		 759 aa  853    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  81.46 
 
 		 765 aa  1238    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  53.13 
 
 		 777 aa  822    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  56.39 
 
 		 773 aa  858    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  56.95 
 
 		 774 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  57.6 
 
 		 759 aa  858    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  52.84 
 
 		 779 aa  826    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6030  malic enzyme  54.98 
 
 		 769 aa  795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  56.76 
 
 		 785 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  56.48 
 
 		 756 aa  867    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  57.41 
 
 		 759 aa  878    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  66.75 
 
 		 770 aa  964    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  56.61 
 
 		 756 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  46.02 
 
 		 757 aa  642    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  53.17 
 
 		 755 aa  782    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  56.18 
 
 		 759 aa  846    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  57.8 
 
 		 759 aa  850    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  59.44 
 
 		 776 aa  922    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  56.63 
 
 		 756 aa  871    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  67.49 
 
 		 774 aa  1024    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  53.97 
 
 		 755 aa  736    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  56.24 
 
 		 756 aa  857    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  56.9 
 
 		 766 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  56.71 
 
 		 766 aa  830    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  56.14 
 
 		 773 aa  836    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  56.48 
 
 		 756 aa  867    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  56.76 
 
 		 785 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  56.71 
 
 		 766 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  48.33 
 
 		 757 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  56.06 
 
 		 769 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>