271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1095 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  68.35 
 
 		 140 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  68.61 
 
 		 138 aa  202  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  67.15 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  66.42 
 
 		 138 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  66.18 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  66.42 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  63.5 
 
 		 145 aa  193  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  64.71 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  67.88 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  67.88 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  63.97 
 
 		 139 aa  183  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  58.82 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  59.56 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  62.04 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  58.09 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  51.88 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  53.08 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  50.77 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  53.08 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  51.54 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  49.23 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  52.31 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  51.54 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  51.54 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  48.84 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  47.06 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  47.69 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  48.85 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.84 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  43.85 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.74 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.66 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.07 
 
 		 146 aa  103  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.31 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.7 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.3 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  37.75 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.43 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.54 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.57 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.4 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.97 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  44.09 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  43.65 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.49 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.5 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  41.46 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.14 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.04 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.19 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  38.17 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.15 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  39.2 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.4 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  42.62 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  39.68 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  39.68 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  42.52 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.06 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  34.16 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.11 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.19 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  34.67 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.72 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.75 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>