152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1799 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 279 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  87.59 
 
 		 283 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  78.06 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  69.78 
 
 		 278 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  74.52 
 
 		 277 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  46.56 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  46.06 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  46.12 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  44.98 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  45.05 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  47.27 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  39.7 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  39.7 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  43.08 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  39.1 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  40 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  43.38 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  41.35 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  38.02 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  38.78 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  39.38 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  37.73 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  36.36 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  37.91 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  37.4 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  39.02 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  37.79 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  34.2 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  35.71 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  37.3 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0310  urease accessory protein UreD  38.87 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1955  urease accessory protein UreD  37.65 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  35.08 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  34.33 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  33.07 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  32.54 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  32.53 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  36.08 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  30.31 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  37.17 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  42.38 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  30.63 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  37.34 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  31.11 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  30.74 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  39.9 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  39.47 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  37.93 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  37.65 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  28.81 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  38.67 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  32.68 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  30.95 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  41.01 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 285 aa  92  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  36.84 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  40.6 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  33.85 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  33.85 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  40.15 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  40.3 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  40.3 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  31.74 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  39.55 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  39.42 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  35.63 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  35.94 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  31.63 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  33.56 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  33.12 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  35.37 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  31.16 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  33.73 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  30.42 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  32.41 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  32.72 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  28.1 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  40.46 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  35.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  33.71 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  35.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  35.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  35.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  35.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  35.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  35.53 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  29.79 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  34.08 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  34.87 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  23.86 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  31.75 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  32.84 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  24.62 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  30.28 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  30.56 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  28.24 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  29.09 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  24.51 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  35.37 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>