More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1669 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.65 
 
 
1191 aa  1388    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  61.64 
 
 
1187 aa  1438    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  61.98 
 
 
1187 aa  1452    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2509  isoquinoline 1-oxidoreductase  62.32 
 
 
759 aa  845    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  43.83 
 
 
976 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  62.46 
 
 
1207 aa  1382    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2491  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.6 
 
 
761 aa  774    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3488  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.81 
 
 
760 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  61.56 
 
 
1187 aa  1428    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3930  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.24 
 
 
766 aa  768    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713425  normal  0.0997312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43790  putative aldehyde dehydrogenase  59.52 
 
 
748 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.813342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1848  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  61.49 
 
 
780 aa  843    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
1183 aa  2373    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  65.69 
 
 
1181 aa  1480    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  61.2 
 
 
1215 aa  1330    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4552  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.3 
 
 
794 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.394306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  61.87 
 
 
1202 aa  1381    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.95 
 
 
1253 aa  1254    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3932  isoquinoline 1-oxidoreductase  62.61 
 
 
764 aa  846    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3673  putative aldehyde dehydrogenase  60.51 
 
 
748 aa  825    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582789  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.36 
 
 
1179 aa  1314    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  62.01 
 
 
1187 aa  1432    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  77.01 
 
 
1182 aa  1731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4329  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  58.98 
 
 
795 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4037  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  58.98 
 
 
795 aa  788    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.05 
 
 
996 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  40.6 
 
 
975 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8451  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  43.72 
 
 
740 aa  516  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3137  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  43.58 
 
 
736 aa  512  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.488373  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0237  Isoquinoline 1-oxidoreductase  43.59 
 
 
741 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.99394  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  47.92 
 
 
806 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  47.92 
 
 
806 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.92 
 
 
831 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.61 
 
 
795 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1181  twin-arginine translocation pathway signal  38.81 
 
 
746 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2505  putative oxidoreductase, beta subunit  40.95 
 
 
756 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3374  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.67 
 
 
731 aa  485  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.977623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3005  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  42.31 
 
 
760 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  56.88 
 
 
433 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  59.65 
 
 
433 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.98 
 
 
432 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1907  twin-arginine translocation pathway signal  41.05 
 
 
749 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.12 
 
 
443 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  48.03 
 
 
424 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  49.53 
 
 
428 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.53 
 
 
425 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  49.53 
 
 
428 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5703  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.01 
 
 
756 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.051575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4956  putative aldehyde dehydrogenase  36.1 
 
 
757 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426554  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.26 
 
 
432 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  48.36 
 
 
426 aa  386  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.12 
 
 
426 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0897  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  38.91 
 
 
713 aa  383  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958278  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5506  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.1 
 
 
754 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5820  putative aldehyde dehydrogenase  35.75 
 
 
753 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.318558  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  46.53 
 
 
467 aa  377  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6356  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
753 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1472  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
753 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7022  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.15 
 
 
753 aa  370  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35241  normal  0.158422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5603  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.1 
 
 
753 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.87 
 
 
433 aa  365  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.72 
 
 
429 aa  361  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.66 
 
 
442 aa  358  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2446  twin-arginine translocation pathway signal  35.34 
 
 
745 aa  356  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  43.26 
 
 
432 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  43.95 
 
 
432 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  46.38 
 
 
420 aa  341  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  45.05 
 
 
424 aa  330  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0863  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  31.55 
 
 
710 aa  325  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3127  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.97 
 
 
728 aa  325  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  44.72 
 
 
497 aa  296  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  44.72 
 
 
452 aa  296  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  44.72 
 
 
452 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  44.47 
 
 
452 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  44.47 
 
 
452 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  44.47 
 
 
452 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  44.47 
 
 
452 aa  293  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4458  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.59 
 
 
670 aa  288  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  43.47 
 
 
492 aa  288  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  42.18 
 
 
425 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.23 
 
 
425 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.86 
 
 
448 aa  283  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3102  molybdopterin-binding xanthine dehydrogenase  33.19 
 
 
707 aa  283  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130356  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  40.64 
 
 
425 aa  281  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.74 
 
 
444 aa  281  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  40.89 
 
 
425 aa  281  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 
425 aa  280  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.73 
 
 
531 aa  280  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.49 
 
 
425 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  40.49 
 
 
425 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  40.49 
 
 
425 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  43.91 
 
 
440 aa  278  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.73 
 
 
531 aa  278  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  39.8 
 
 
430 aa  277  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  42.64 
 
 
691 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  40.81 
 
 
415 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.29 
 
 
440 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.18 
 
 
403 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  41.47 
 
 
415 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>