25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0716 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 372 aa  753    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  88.44 
 
 		 372 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  82.26 
 
 		 372 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1107  hypothetical protein  27.92 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1233  hypothetical protein  27.24 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0143332  normal  0.037479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0961  hypothetical protein  28.27 
 
 		 413 aa  125  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1382  hypothetical protein  26.57 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1559  hypothetical protein  27.3 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158764  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01915  hypothetical protein  27.42 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  34.81 
 
 		 458 aa  99.8  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  38.86 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  30.19 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  35.67 
 
 		 1066 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  36.57 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  33.09 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 1300 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.84 
 
 		 647 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  30.51 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  28.33 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 1831 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  30.95 
 
 		 521 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3949  hypothetical protein  27.34 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 550 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>