92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3272 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3272  myo-inositol catabolism IolB  100 
 
 		 269 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3498  iolB protein  89.59 
 
 		 269 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50060  Myo-inositol catabolism protein IolB  65.3 
 
 		 275 aa  384  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1603  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  57.04 
 
 		 268 aa  327  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2650  iolB protein  58.74 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1674  myo-inositol catabolism protein IolB  57.41 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1441  myo-inositol catabolism protein IolB  57.41 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.651397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0439  iolB protein  57.41 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1652  myo-inositol catabolism protein IolB  57.41 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.497048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0723  myo-inositol catabolism protein IolB  57.41 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0910  iolB protein  57.41 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1323  putative myo-inositol catabolism LolB protein  55.93 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1828  iolB protein  57.04 
 
 		 267 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2812  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  56.67 
 
 		 266 aa  314  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0555843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3317  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.78 
 
 		 265 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1598  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  55.69 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1300  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  55.35 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.65 
 
 		 272 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  54.65 
 
 		 272 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.98 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.98 
 
 		 272 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  54.28 
 
 		 271 aa  284  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0984  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.41 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1895  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  54.24 
 
 		 272 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.211847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0068  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  55.22 
 
 		 275 aa  281  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00478014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3559  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  51.67 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1237  putative myo-inositol catabolism protein  53.67 
 
 		 271 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0979  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.93 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1132  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  50.56 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4662  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.5 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3039  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  53.5 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2967  putative myo-inositol catabolism protein IolB  53.5 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2994  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  53.91 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0080  hypothetical protein  48.7 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1868  hypothetical protein  53.09 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0212123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5746  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  47.04 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  53.09 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3332  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  51.81 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4702  protein IolB  49.06 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000356278  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3840  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.33 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0672  iolB protein  48.34 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1587  myo-inositol catabolism protein  45.93 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000101731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0455  myo-inositol catabolism IolB region  45.72 
 
 		 271 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  48.21 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3286  hypothetical protein  48.21 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1672  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  46.1 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7801  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  45.56 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2415  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  47.06 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1717  myo-inositol catabolism IolB region  46.49 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2313  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  45.08 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1279  myo-inositol catabolism IolB domain protein  44.07 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286667  normal  0.249496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1525  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  42.62 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1429  myo-inositol catabolism IolB protein  41.64 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191382  normal  0.741478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.65 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5701  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.75 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  36.36 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1700  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.55 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0499  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.37 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.777843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  34.78 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1576  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.78 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1254  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  33.08 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1801  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  39.19 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.359842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3607  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  39.59 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.782591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0660  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  37.35 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0278  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.75 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2744  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.7 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5450  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.07 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5565  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.29 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8492  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  36.29 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0835  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.3 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.676386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4018  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  35.23 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3076  Myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.18 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  34.85 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0957  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34.14 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4057  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  32.87 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6847  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  33.82 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1368  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  34 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4540  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  32.7 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1724  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  35.96 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0727  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  37.3 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2301  myo-inositol catabolism protein  27.05 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2533  putative iolB protein  27.05 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61055e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2338  iolB protein  27.05 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2517  myo-inositol catabolism protein IolB  27.05 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2257  myo-inositol catabolism protein  27.05 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1418  myo-inositol catabolism IolB protein  28.52 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0783277  normal  0.109536 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0306  myo-inositol catabolism protein  27.05 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3350  myo-inositol catabolism IolB protein  27.59 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497522  normal  0.203778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1267  hypothetical protein  27.11 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647401  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4017  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  24.36 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0372282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0083  putative myo-inositol catabolism protein IolB  24.91 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1777  protein involved in inositol metabolism-like protein  30.19 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>