More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3223 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3223  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
311 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0595343  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3441  glycosyl transferase, group 2 family protein  83.6 
 
 
311 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 
276 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  36.86 
 
 
357 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  46.53 
 
 
801 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  42.86 
 
 
336 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0318  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
285 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0743987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
316 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
322 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
596 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.75 
 
 
329 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.42 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1419  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.74 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 
597 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  39.69 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  32.33 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4043  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
450 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
573 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 
727 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  35.17 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
1250 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  35.61 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.43 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  36.03 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  38.14 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.88 
 
 
466 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
1035 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.64 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  37.19 
 
 
1038 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  37.4 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
703 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
1032 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  34.17 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
361 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.26 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.07 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  34.09 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.51 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
663 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.03 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.72 
 
 
253 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>