146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2609 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2609  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 403 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.194987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2590  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  25.67 
 
 		 685 aa  90.1  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6052  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5822  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.36 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1653  hypothetical protein  24.32 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.57291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 		 256 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1571  hypothetical protein  24.32 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.63 
 
 		 269 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  24.15 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.78 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  24.6 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1230  hypothetical protein  23.37 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.33 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  20.97 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  27.71 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 		 265 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 		 260 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.58 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  21.37 
 
 		 271 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.11 
 
 		 286 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  23.53 
 
 		 315 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  23.53 
 
 		 315 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.45 
 
 		 256 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 300 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4708  coronamic acid synthetase CmaE  26.64 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.73 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  25.21 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  28.85 
 
 		 271 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  27.96 
 
 		 270 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  26.82 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  24.8 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  23.72 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  22.08 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  22.08 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 		 263 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  21.76 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 260 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  24.43 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  24.43 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  29.36 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  24.43 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  26.02 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  27.66 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  22.83 
 
 		 263 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 260 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.53 
 
 		 282 aa  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.14 
 
 		 286 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 262 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  24.22 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 250 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  24.22 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  25.44 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  22.05 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  24.69 
 
 		 7149 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 297 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 226 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  22.22 
 
 		 261 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 361 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  27.47 
 
 		 262 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 301 aa  46.6  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 288 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25.4 
 
 		 256 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 300 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.83 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>