38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2284 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  81.11 
 
 		 184 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  59.78 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  58.38 
 
 		 199 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  55.62 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  57.22 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  55.49 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  51.98 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  45.45 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  43.24 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  45.06 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  42.16 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  32.02 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
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NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  27.53 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
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NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
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NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
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NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
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NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
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NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 209 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
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