More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1012 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  87.93 
 
 
403 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
406 aa  832    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  73.97 
 
 
396 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  73.91 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  74.28 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  72.63 
 
 
404 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  72.7 
 
 
406 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  72.8 
 
 
403 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  68.16 
 
 
406 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  68.68 
 
 
406 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  69.23 
 
 
400 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  51.87 
 
 
432 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  52.34 
 
 
413 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  49.6 
 
 
403 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  51.18 
 
 
416 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  48.23 
 
 
378 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  52.41 
 
 
408 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  46.79 
 
 
373 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  44.36 
 
 
655 aa  323  5e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  46.68 
 
 
381 aa  322  6e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  45.01 
 
 
405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  47.85 
 
 
390 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  47.85 
 
 
390 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  46.45 
 
 
385 aa  312  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  45.05 
 
 
398 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  40.73 
 
 
441 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.08 
 
 
373 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  39.89 
 
 
393 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  43.08 
 
 
378 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  39.46 
 
 
377 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 
381 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.85 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
380 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
387 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
380 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 
416 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
381 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
380 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
376 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 
380 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
377 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.17 
 
 
380 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
377 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
377 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
379 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
381 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.27 
 
 
380 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.27 
 
 
380 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
380 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.63 
 
 
377 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
378 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
387 aa  199  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.82 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.05 
 
 
377 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  30.47 
 
 
376 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  32.61 
 
 
381 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  33.6 
 
 
381 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.5 
 
 
377 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
810 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.91 
 
 
377 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  32.81 
 
 
381 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  31.97 
 
 
382 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.27 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.99 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.72 
 
 
382 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.27 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
381 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
772 aa  189  7e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
363 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
378 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
390 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
353 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
420 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
394 aa  186  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
373 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
384 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 
354 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
342 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
344 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
344 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
344 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
344 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
393 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
344 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
344 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.88 
 
 
344 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.63 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
871 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  33.78 
 
 
355 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
344 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  38.49 
 
 
343 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
344 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
344 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
350 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
820 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
426 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>