28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0437 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  362  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  93.18 
 
 		 176 aa  342  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  62.21 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  35.88 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  37.7 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  30.73 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  30.84 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1801  hypothetical protein  24.6 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  28.93 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  29.13 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  41.94 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0553  hypothetical protein  28.37 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  29.37 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3221  hypothetical protein  25.76 
 
 		 267 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  27.81 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  30.17 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  26.79 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  27.43 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  28 
 
 		 219 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  33.72 
 
 		 100 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  28.83 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0963382  hitchhiker  0.00119035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  31.4 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2102  hypothetical protein  30.19 
 
 		 228 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>