31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4367 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  97.32 
 
 		 375 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  94.05 
 
 		 336 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  98.21 
 
 		 336 aa  680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  79.17 
 
 		 335 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  71.13 
 
 		 335 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  70.83 
 
 		 335 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  72.64 
 
 		 337 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  61.61 
 
 		 333 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  61.61 
 
 		 335 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  46.15 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  45.86 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  46.69 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  46.06 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  41.91 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  41.4 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  44.38 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  27.6 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  27.22 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  27.22 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  24.78 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  24.69 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  24.46 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  23.59 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  21.66 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  24.47 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  24.44 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  22.22 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  21.85 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  22.22 
 
 		 347 aa  46.2  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  34.69 
 
 		 177 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>