21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3750 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  43.51 
 
 
319 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  40.2 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  41.16 
 
 
315 aa  232  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  38.91 
 
 
319 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  41.8 
 
 
311 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  36.08 
 
 
322 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  36.6 
 
 
299 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  33.77 
 
 
307 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  35.37 
 
 
304 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  32.68 
 
 
317 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  35.58 
 
 
313 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  30.77 
 
 
309 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  34.69 
 
 
323 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  29.91 
 
 
316 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  29.86 
 
 
1746 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  25.91 
 
 
1708 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  25.19 
 
 
1597 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  26.51 
 
 
1059 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4382  hypothetical protein  25.73 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  30.91 
 
 
319 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>