68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3689 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
101 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  96.04 
 
 
101 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  96.04 
 
 
101 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  95.05 
 
 
101 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  72.28 
 
 
99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  66.34 
 
 
101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  64.36 
 
 
101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  62.38 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  61.39 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  60 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  61.39 
 
 
115 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  60.4 
 
 
100 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  49.49 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  46 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  49.48 
 
 
101 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  46 
 
 
112 aa  87  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.08 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.86 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  46.51 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  38 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  44.19 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  38.64 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  39.6 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  43.53 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  31.63 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  34.65 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.77 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  36.08 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  36.67 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  35.23 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  34.09 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  34.09 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  34.09 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  30.77 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 
105 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  31.33 
 
 
520 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.12 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0152  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  37.5 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  25.56 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  24.18 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 
101 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0196  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  28.92 
 
 
568 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  27.91 
 
 
580 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.36 
 
 
111 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>