48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2054 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  86.18 
 
 		 463 aa  836    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  944    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  86.61 
 
 		 463 aa  838    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  62.86 
 
 		 471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  34.35 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  34.35 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  34.35 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  35.94 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  35.48 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  33.41 
 
 		 502 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  35.71 
 
 		 530 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  33.64 
 
 		 509 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  33.88 
 
 		 553 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  33.64 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  33.64 
 
 		 477 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  32.49 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  33.64 
 
 		 561 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  31.62 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  32.32 
 
 		 514 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  32.08 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  31.38 
 
 		 510 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  31.38 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  31.38 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  32.56 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  31.38 
 
 		 514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  31.67 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  32.2 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  33.59 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  31.82 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  31.46 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  27.69 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  28.12 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  25.89 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  29.91 
 
 		 564 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  28.31 
 
 		 481 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  24.68 
 
 		 231 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  28.07 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  27.95 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  25.9 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  26.56 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  22.41 
 
 		 511 aa  57  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  24.45 
 
 		 513 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  24.09 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  24.47 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  24.86 
 
 		 514 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  24.22 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1806  hypothetical protein  51.16 
 
 		 130 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  30.22 
 
 		 473 aa  43.5  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>