83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0493 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  256  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  95.28 
 
 		 128 aa  245  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  94.49 
 
 		 128 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  94.49 
 
 		 128 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  72.44 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  61.72 
 
 		 128 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  68.75 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  68.75 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  47.66 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  50.78 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  51.56 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  46.09 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  48.44 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  44.09 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  45.6 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  44.53 
 
 		 243 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  43.2 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  44 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  44.53 
 
 		 243 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  42.4 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  43.1 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  46.03 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  46.03 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  42.4 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  45.24 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  43.1 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  40.8 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  40.62 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  38.21 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  40.62 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  40.62 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  44.44 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  42.74 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  38.02 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  38.84 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  34.68 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  39.64 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  40.32 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  37.84 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  37.4 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  45.95 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  37.4 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  36.59 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  36.15 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  38.84 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  41.41 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  36 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  36.43 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  39.52 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  41 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  33.03 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  41.18 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  36.22 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  45.05 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  32.26 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  36.84 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  32.48 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  29.91 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  29.91 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  29.13 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  29.76 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01340  expressed protein  27.87 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0155606  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  25.77 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  29.21 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  33.04 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  26.8 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  35.24 
 
 		 135 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  35.24 
 
 		 135 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>