36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4075 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  88.46 
 
 		 286 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  88.46 
 
 		 286 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  77.27 
 
 		 286 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  60.9 
 
 		 289 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  52.8 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  52.84 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  47.57 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  35.71 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  34.59 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  26.45 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  23.66 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  24.45 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  23.97 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  22.18 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  23.38 
 
 		 283 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  24.25 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  23.4 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  22.22 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  21.8 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  21.8 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  21.8 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  25.77 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  23.4 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  23.97 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  24.15 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  26.02 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  25.56 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  25.82 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  27.16 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  23.62 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  25.47 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  25.63 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>