More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1526 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1526  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1992  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  94.01 
 
 
334 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550261  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3769  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  94.01 
 
 
334 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614243  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1553  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  87.39 
 
 
334 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.340433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1894  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.96 
 
 
336 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.96 
 
 
337 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3819  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.96 
 
 
337 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2719  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.78 
 
 
336 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.356542  normal  0.074125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.28 
 
 
336 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2017  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
336 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00533775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23810  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
336 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  normal  0.41166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1650  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00338188  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.54 
 
 
340 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
338 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.9 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  39.7 
 
 
338 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
339 aa  265  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
338 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
338 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2152  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
338 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000198984  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  40.06 
 
 
340 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
338 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
338 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.12 
 
 
337 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1613  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
338 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000186594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
338 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  39.1 
 
 
338 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
337 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
338 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.18 
 
 
338 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  39.17 
 
 
340 aa  255  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.99 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
341 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.69 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
342 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.21 
 
 
337 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
341 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
340 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
340 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
340 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
340 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
340 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0940  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
340 aa  238  8e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.281567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.69 
 
 
339 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
344 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
339 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
339 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1528  putative semialdehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
336 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
339 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1419  putative semialdehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
336 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0362  putative semialdehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
336 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.857997  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.61 
 
 
340 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
344 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.82 
 
 
336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3335  putative semialdehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
336 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0020501  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2801  putative semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
336 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.778935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2613  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
339 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2697  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2475  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2611  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  normal  0.0361352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2511  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2599  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2557  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2720  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02244  hypothetical protein  40.24 
 
 
337 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1337  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1333  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02204  hypothetical protein  40.24 
 
 
337 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2470  putative semialdehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
337 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
348 aa  215  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3459  putative semialdehyde dehydrogenase  39.94 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2577  putative semialdehyde dehydrogenase  39.64 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.73 
 
 
340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
344 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 
344 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1367  putative semialdehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
336 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 
344 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 
344 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 
344 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
340 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.54 
 
 
344 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.63 
 
 
344 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.73 
 
 
344 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
341 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.93 
 
 
344 aa  208  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.75 
 
 
340 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
349 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>