More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3181 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
534 aa  1053    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0640  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
534 aa  1053    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1635  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  99.63 
 
 
534 aa  1049    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.34 
 
 
497 aa  336  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.73 
 
 
519 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  35.44 
 
 
522 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.97 
 
 
525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.2 
 
 
535 aa  312  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  35.56 
 
 
501 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.05 
 
 
510 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.72 
 
 
535 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.86 
 
 
535 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.19 
 
 
542 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.19 
 
 
542 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.19 
 
 
542 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  35.77 
 
 
502 aa  287  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  34.96 
 
 
502 aa  286  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.44 
 
 
585 aa  286  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.71 
 
 
507 aa  286  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.86 
 
 
501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4070  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.84 
 
 
488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000278055  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.18 
 
 
521 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.06 
 
 
534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  35.62 
 
 
512 aa  283  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.37 
 
 
508 aa  282  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000116263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  34.76 
 
 
502 aa  282  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.32 
 
 
527 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.32 
 
 
527 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5945  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.19 
 
 
492 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.32 
 
 
527 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.93 
 
 
503 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  35.39 
 
 
489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  36.11 
 
 
502 aa  273  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  35.84 
 
 
503 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.68 
 
 
517 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  36.32 
 
 
515 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.52 
 
 
516 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  36.29 
 
 
514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.7 
 
 
525 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1604  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.33 
 
 
519 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.12 
 
 
506 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  33.47 
 
 
504 aa  270  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.73 
 
 
506 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0193  NADH dehydrogenase subunit M  34.01 
 
 
507 aa  270  7e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  33.96 
 
 
505 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  32.7 
 
 
503 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.73 
 
 
519 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  36.03 
 
 
505 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.81 
 
 
503 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4546  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.14 
 
 
545 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.814127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  34.27 
 
 
505 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  32.7 
 
 
503 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.39 
 
 
490 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  33.86 
 
 
511 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.63 
 
 
517 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  34.94 
 
 
502 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  32.11 
 
 
510 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  33.66 
 
 
513 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  35.87 
 
 
513 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.96 
 
 
491 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  33.86 
 
 
513 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  32.11 
 
 
510 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  32.67 
 
 
496 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  32.11 
 
 
510 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.18 
 
 
507 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  35.6 
 
 
494 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  33.62 
 
 
511 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.01 
 
 
493 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  33.78 
 
 
511 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.21 
 
 
537 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  33.6 
 
 
513 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  32.26 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  32.26 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  32.26 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  32.26 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  32.26 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3897  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.89 
 
 
482 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  32.26 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  32.26 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.53 
 
 
495 aa  261  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  33.33 
 
 
502 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  32.67 
 
 
494 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.67 
 
 
494 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.9 
 
 
505 aa  259  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  31.86 
 
 
496 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.45 
 
 
520 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  32.21 
 
 
509 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.06 
 
 
508 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2047  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.97 
 
 
506 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.688388  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  31.86 
 
 
496 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4053  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.1 
 
 
510 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  31.86 
 
 
496 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  32.02 
 
 
509 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>