31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2977 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
100 aa  199  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  62.37 
 
 
99 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  64.52 
 
 
98 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  58.7 
 
 
103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  44.94 
 
 
99 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  34.69 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  25.88 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 
103 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  33.7 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  35.42 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  32.98 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  32.61 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  32.88 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  30.14 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  39.66 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  35.16 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  31.52 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  32.61 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  34.33 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  35.14 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  34.92 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  28.74 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  28.28 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  32.97 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  30.43 
 
 
100 aa  40  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  30.77 
 
 
96 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>