More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1929 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.82 
 
 
288 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  69.86 
 
 
295 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  57.31 
 
 
416 aa  299  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  54.83 
 
 
285 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  50.97 
 
 
292 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.69 
 
 
317 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  55.3 
 
 
401 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  56.15 
 
 
285 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.34 
 
 
308 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50 
 
 
471 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  53.91 
 
 
297 aa  278  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  52.07 
 
 
291 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  49.12 
 
 
301 aa  275  8e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  49.05 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.75 
 
 
303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  50.96 
 
 
415 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  49 
 
 
286 aa  271  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  47.71 
 
 
272 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  48.48 
 
 
290 aa  269  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  50.82 
 
 
293 aa  268  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.69 
 
 
300 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  51.23 
 
 
297 aa  267  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.12 
 
 
293 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  48.46 
 
 
278 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  43.92 
 
 
296 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  50.78 
 
 
288 aa  263  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  51.08 
 
 
280 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  46.74 
 
 
302 aa  262  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.62 
 
 
287 aa  257  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  46 
 
 
304 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.74 
 
 
289 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  46.59 
 
 
269 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  46.37 
 
 
298 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.45 
 
 
289 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.36 
 
 
289 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  45.1 
 
 
302 aa  249  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  48.58 
 
 
280 aa  248  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.67 
 
 
270 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  47.2 
 
 
297 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.91 
 
 
289 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  43.24 
 
 
298 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  43.38 
 
 
341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  46.33 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  45.17 
 
 
278 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  44.19 
 
 
265 aa  235  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  49.6 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.41 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  47.41 
 
 
375 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.15 
 
 
266 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  46.99 
 
 
373 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  46.12 
 
 
368 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  42.38 
 
 
291 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  43.64 
 
 
296 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  44.18 
 
 
382 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46.03 
 
 
305 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  46.72 
 
 
394 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  44.09 
 
 
374 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  43.12 
 
 
358 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  46.47 
 
 
379 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  43.12 
 
 
358 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1702  MRP ATP/GTP-binding protein  42.96 
 
 
287 aa  221  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154362  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  40.97 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.49 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  41.61 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  43.4 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  44.22 
 
 
374 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.14 
 
 
363 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.31 
 
 
376 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  44.22 
 
 
361 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  43.58 
 
 
370 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  43.57 
 
 
302 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.01 
 
 
298 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  44.21 
 
 
359 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  46.49 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  45.49 
 
 
361 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.72 
 
 
247 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  39.08 
 
 
368 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  43.08 
 
 
367 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  44.19 
 
 
376 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  43.53 
 
 
372 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  44.19 
 
 
373 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  44.66 
 
 
358 aa  214  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.35 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  42.48 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.74 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.91 
 
 
247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.8 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  45.08 
 
 
363 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  42.74 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  45.06 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  43.55 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  43.54 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  43.02 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  43.02 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  41.13 
 
 
364 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  44.19 
 
 
362 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  47.11 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  44.84 
 
 
358 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  42.47 
 
 
372 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>