More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0730 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  100 
 
 
153 aa  304  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2984  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.71 
 
 
162 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.38 
 
 
162 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2590  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.72 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.05 
 
 
164 aa  103  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 
165 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
158 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 
168 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
179 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.4 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.61 
 
 
167 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
184 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40 
 
 
167 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2241  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
202 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0585336  normal  0.241237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.51 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2284  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 
195 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151549  normal  0.0451993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4225  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
186 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  0.0214287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2110  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.42 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.326827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2559  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
195 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.599331  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_004310  BR1836  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.51 
 
 
182 aa  91.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2930  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.36611  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1769  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.51 
 
 
178 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0166  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.13 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0260  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.71 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.88 
 
 
164 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3709  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.66 
 
 
206 aa  88.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0451  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.01 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.48 
 
 
175 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.74 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0564  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0527  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.13 
 
 
179 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.741334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4735  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
182 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000037989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
160 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.43 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4211  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.12 
 
 
177 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.22 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0412  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.62 
 
 
168 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.309928 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1735  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.37 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
171 aa  85.1  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.96666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3887  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
177 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144161  normal  0.0314277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.31 
 
 
172 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.56 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.74 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.5 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.54 
 
 
197 aa  82  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3846  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.66 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.14 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.5 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00110033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.16 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4218  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.17 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
215 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.046247  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.97 
 
 
187 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2647  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
231 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0104  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
214 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.640787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0556  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
214 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000501582  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0586  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
214 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0927743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5146  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.17 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.17 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0514  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.561307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0319  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.17 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.51 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.51 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1770  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.97 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5378  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.88 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290228  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0347  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase, putative  35.71 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.163328  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0512  putative (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0561  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.02 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1470  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3444  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00155901  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0489  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.46 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.46 
 
 
235 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.21 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.42 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5053  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.17 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483238  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48240  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.88 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.72 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1117  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5285  mutT/nudix family protein  35.46 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0992  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4843  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.46 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2797  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.81 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1227  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.46 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000249848  hitchhiker  0.00278569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1273  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.12 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.94 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2123  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.68 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0183314  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0396  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  0.770982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1021  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.78 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480643  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.93 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2393  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.89 
 
 
221 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.783924  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1038  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.78 
 
 
174 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2953  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.13 
 
 
231 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.62 
 
 
193 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.11 
 
 
216 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>