More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0562 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  81.25 
 
 		 261 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  76.95 
 
 		 256 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  72.27 
 
 		 257 aa  367  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  74.6 
 
 		 257 aa  364  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  60.31 
 
 		 269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  63.18 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  56.93 
 
 		 270 aa  279  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  55.98 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  56.79 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  53.94 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  50.2 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  51.15 
 
 		 267 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  50.81 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  47.81 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  48.44 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  48.44 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  48.44 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  48.44 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  48.44 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  48.44 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  47.66 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  46.03 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  44.23 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  44.62 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  47.2 
 
 		 265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  45.24 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  43.92 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  46.48 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  43.36 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  44.05 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  44.05 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  47.22 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  46.83 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  44.53 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  45.45 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  44.84 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  48.18 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  43.97 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  46.43 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  45.45 
 
 		 265 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  49 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  48.62 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  50.47 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  44.06 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  45.06 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  44.19 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  47.95 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  49.53 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  49.07 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  49.06 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  45.49 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  47.24 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  43.25 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  44.05 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  43.65 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  48.17 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  43.25 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  43.65 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  43.65 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  43.65 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  43.65 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  43.65 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  43.65 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  43.25 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  43.25 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  43.25 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  43.65 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  43.65 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  46.64 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  43.25 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  47.66 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  47.71 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  43.25 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  44.58 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  43.25 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  43.65 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  42.97 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  47.01 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  44.05 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  44.05 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  44.05 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  44.44 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  44.05 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  44.66 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>