34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0486 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  51.72 
 
 		 180 aa  191  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  44.51 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.29 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  42 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  36.99 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  36.67 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  37.71 
 
 		 173 aa  97.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  31.9 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  39.13 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  32.67 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.68 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  23.94 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  26.89 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  26 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  31.39 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.08 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  25.3 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  21.77 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  26.35 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.9 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  26.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  26.77 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  21.77 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  21.77 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  24.2 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.01 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>