35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4662 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 315 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  48.46 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  44.76 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  42.52 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  42.18 
 
 		 319 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  42.18 
 
 		 319 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  42.62 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  42.9 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  42.37 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  42.76 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  42.12 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  38.94 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  38.91 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  39.01 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  30.35 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  31.66 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  29.71 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  29.71 
 
 		 367 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  31.58 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  29.67 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  29.19 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  29.82 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  30.03 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  30.62 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  28.03 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  27.78 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  26.77 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  24.21 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  30.43 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  30.43 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  23.7 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  28.03 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  31.94 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  28.64 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>