More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2100 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
400 aa  802    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  65.41 
 
 
422 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  59.01 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  53.66 
 
 
390 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  50.13 
 
 
381 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  48.05 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  46.93 
 
 
377 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  47.93 
 
 
391 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  46.74 
 
 
408 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 
404 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  45.99 
 
 
391 aa  285  9e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4687  glycosyl transferase group 1  34.79 
 
 
367 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6665  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
433 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
370 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1218  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 
364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0060  glycosyltransferase  48.41 
 
 
174 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
381 aa  93.2  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
366 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
1229 aa  89.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
370 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
420 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
366 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
431 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
371 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  37.64 
 
 
1915 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
609 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.69 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
831 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.23 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  39.74 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.67 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  31.84 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  32.24 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.13 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  30.59 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
434 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  21.94 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.22 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.58 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2371  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0291756  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
1089 aa  77  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  32.95 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2942  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.72 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  21.81 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>