More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0561 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  100 
 
 		 149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  51.03 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  53.38 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  53.38 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  42.76 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 147 aa  110  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  44.08 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 165 aa  105  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0106  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  31.51 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  35.17 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  36.09 
 
 		 191 aa  92  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  35.17 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  35.34 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  34.01 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 178 aa  90.1  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  34 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  33.83 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  37.84 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 209 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 189 aa  87.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  32.19 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  30.34 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  35.34 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 174 aa  84.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 193 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>