More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0166 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  100 
 
 
187 aa  361  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  48.07 
 
 
199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  42.33 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  43.11 
 
 
172 aa  131  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  42.59 
 
 
176 aa  130  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  40.56 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  42.51 
 
 
200 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  38.76 
 
 
179 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  39.52 
 
 
172 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  32.97 
 
 
195 aa  117  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  35.59 
 
 
189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  32.07 
 
 
183 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  31.52 
 
 
183 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  40.62 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  44.12 
 
 
154 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  34.52 
 
 
416 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  34.34 
 
 
174 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  37.5 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  32.16 
 
 
171 aa  98.2  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  32.93 
 
 
213 aa  94.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.25 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  33.73 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  29.65 
 
 
184 aa  91.3  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  33.52 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  30.22 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  29.26 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  31.33 
 
 
420 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  31.21 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  34.88 
 
 
192 aa  87.8  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  40.5 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  27.13 
 
 
184 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.74 
 
 
450 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.06 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  30.99 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  36.72 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30 
 
 
174 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  33.59 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  32.56 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  35.92 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  31.22 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  28.57 
 
 
446 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.25 
 
 
441 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  31.22 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.78 
 
 
415 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  32.56 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  32.61 
 
 
428 aa  82  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  32.61 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  34.59 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  27.72 
 
 
390 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  31.03 
 
 
385 aa  81.3  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 
395 aa  80.9  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  29.76 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  34.59 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.92 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  30.14 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.81 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  37.4 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  28.83 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  28.82 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.89 
 
 
441 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  28.14 
 
 
456 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  31.58 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  29.2 
 
 
393 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  27.78 
 
 
450 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.2 
 
 
392 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0727  Chromate transporter  28.19 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000305738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  28.83 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  28.67 
 
 
383 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  26.75 
 
 
442 aa  77.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  26.19 
 
 
394 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  30.29 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  30.46 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.46 
 
 
382 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  29.91 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  29.91 
 
 
390 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  27.74 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.14 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1287  chromate transporter  33.81 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  32.47 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  27.89 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  36.84 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.14 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  37.12 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.67 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  27.54 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  37.17 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  26.9 
 
 
397 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  27.81 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  35.64 
 
 
417 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  32.47 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  27.63 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  30.99 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  28.8 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  28.8 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  31.37 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  30.97 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  26.79 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  32.97 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  28.74 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  39.36 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>