More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0010 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 65 aa  133  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  66.15 
 
 		 67 aa  96.7  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  66.15 
 
 		 67 aa  96.7  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  64.62 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  64.62 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  64.62 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  64.62 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  64.62 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  64.62 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  64.62 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.49 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 		 65 aa  92.8  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.74 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  71.43 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  70 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  67.74 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 65 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  67.19 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.33 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 65 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 65 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 65 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  60.94 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  64.62 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  60.94 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  65.62 
 
 		 77 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  64.62 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  64.62 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.54 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  61.54 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  61.54 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  61.54 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  61.54 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  64.52 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  61.54 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.9 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 68 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 		 65 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  61.54 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  68.33 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  59.38 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  63.49 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3013  cold-shock DNA-binding domain protein  64.52 
 
 		 65 aa  87.8  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000213425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0754  cold-shock DNA-binding domain protein  58.46 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  61.9 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  63.08 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  63.08 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  63.08 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  63.08 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  63.08 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  63.08 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  63.08 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  60 
 
 		 65 aa  87.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  59.38 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 65 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  60.61 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  60 
 
 		 65 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  60.61 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  60.61 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>